《小龙万迪》动画讲述的是当高科技超出普通人的认知的时候，就会当作一种神奇的魔法。而埃尔学校，就是这么一所充满了欢乐和智慧、神奇又瑰丽的魔法学校。这里传授知识、鼓励探索、激发创造，是全世界孩子们都向往的地方。布丁、茉莉、豆宝是埃尔学校二年级的学生,他们热爱冒险、敢于探索，是学校里出了名的“探险三人组”!一天晚上,三个孩子在校长办公室里发现了一只具有超能量的小龙和一本古怪的书籍,小龙带着他们进入到书里的世界，原来这就是传说中的“万迪乐园”！在这里，孩子们竟然意外地遇到了失踪多年的校长埃尔博士!随着博士的现身，沉寂多年的万迪乐园之谜也再次浮出了水面。为了解开博士留下的秘密，三个孩子带着小龙一起回到了埃尔学校，并给它取名为小龙万迪。小龙万迪的到来，给小伙伴们的学校生活增加了许多不可思议的意外。与此同时，学校里却有不坏好意的人发现了这个秘密，并暗中觊觎小龙万迪的神奇能量。在与坏人斗智斗勇的过程中，孩子们保护万迪躲过了一次又一次的危险，而万迪也帮助孩子们锻炼了勇气和信心，逐渐地成长起来。于是，奇妙有趣的故事就此展开……